31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0502 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 124 aa  241  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4093  DNA polymerase beta subunit  45.16 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.792908  normal  0.694143 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3517  DNA polymerase beta subunit  34.74 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.909261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0603  hypothetical protein  29.7 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0280  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175333  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  34.88 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2315  DNA polymerase beta domain protein region  32.17 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  29.79 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  37.18 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  37.97 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3941  DNA polymerase beta domain protein region  24.21 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  25.97 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3358  hypothetical protein  36.78 
 
 		 265 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  40.85 
 
 		 133 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2754  hypothetical protein  37.65 
 
 		 115 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604602  hitchhiker  0.000634444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 144 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1646  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0702167  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1728  hypothetical protein  40.38 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  37.18 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  33.65 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  32.56 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  31.65 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  29.55 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1193  DNA polymerase beta domain protein region  25.25 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  32.86 
 
 		 206 aa  40  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  32.95 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>