23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1516 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  42.78 
 
 		 199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  41.18 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  34.39 
 
 		 209 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  36.57 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  35.16 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  32.62 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  30.06 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  30.06 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  30.06 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  28.33 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  28.39 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3684  hypothetical protein  23.46 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3250  putative transcriptional regulator, GntR family  23.17 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  24.29 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00270  hypothetical protein  28.99 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  23.53 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2115  DNA polymerase beta subunit  26.29 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  23.02 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  25.97 
 
 		 124 aa  43.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2688  DNA polymerase beta domain protein region  27.82 
 
 		 229 aa  41.2  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.373799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>