31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2615 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  48.42 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  49.2 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  44.33 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  46.15 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  36.57 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  36.65 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  36.26 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  36.65 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3684  hypothetical protein  31.68 
 
 		 176 aa  91.7  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3250  putative transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  27.17 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  29.3 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  25.45 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00270  hypothetical protein  30.38 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  30.26 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2115  DNA polymerase beta subunit  28.16 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 111 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1495  DNA polymerase beta domain protein region  30.4 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2688  DNA polymerase beta domain protein region  25.41 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.373799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  32.11 
 
 		 113 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2688  hypothetical protein  28.21 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  30.39 
 
 		 106 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1200  DNA polymerase beta subunit  27.84 
 
 		 111 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  28.42 
 
 		 117 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  28.92 
 
 		 111 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  33.75 
 
 		 115 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>