16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1277 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1200  DNA polymerase beta subunit  77.48 
 
 		 111 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  33.61 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  34.48 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  36.54 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 195 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  29.17 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  26.44 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  33 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1405  hypothetical protein  26.42 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  35.53 
 
 		 121 aa  44.3  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5274  hypothetical protein  34.38 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  22.77 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  30.43 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0086  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109385  normal  0.256886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>