26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0203 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 155 aa  317  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  62.75 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5274  hypothetical protein  49.52 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5202  DNA polymerase beta domain protein region  47.67 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4735  DNA polymerase beta subunit  50.75 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  36.54 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  28.07 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  29.89 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  29.33 
 
 		 103 aa  44.3  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  29.9 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1200  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  28.24 
 
 		 111 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  35.63 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  35.63 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  31.11 
 
 		 113 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  27.1 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  30.23 
 
 		 117 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.65 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  30.34 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  31.33 
 
 		 114 aa  41.2  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  34.95 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1405  hypothetical protein  27.18 
 
 		 117 aa  40.8  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  39.53 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>