25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0524 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  36.45 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  43.93 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  39.25 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  30.63 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  31.97 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5202  DNA polymerase beta domain protein region  31.4 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1200  DNA polymerase beta subunit  30.48 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  36.26 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  43.48 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  37.93 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  36.26 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  27.59 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  30.43 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  27.1 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  32.08 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  38.1 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  29.82 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1405  hypothetical protein  29.33 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>