26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1643 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 115 aa  219  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  35.96 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  39.25 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  34.29 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  31.19 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  34.95 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  29.91 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  48.84 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  32.56 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0998  DNA polymerase beta subunit  24.77 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0594708  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0146  nucleotidyltransferase family protein  35.42 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0363177  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5202  DNA polymerase beta domain protein region  28.89 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0603  hypothetical protein  35.63 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  42 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  28.3 
 
 		 111 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  27.08 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4026  DNA polymerase beta domain protein region  44.64 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  37.74 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  32.53 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>