23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0018 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 117 aa  237  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  45.61 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  43.48 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 119 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  35.96 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  46.81 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  40.21 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  35.96 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  37.66 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 171 aa  47  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  31.97 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  33.64 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  44.68 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  35.63 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  28.3 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  30.23 
 
 		 155 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  29.89 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  66.67 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  55.88 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  40.38 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  42.86 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>