68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0317 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 121 aa  236  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  32.74 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0086  DNA polymerase beta subunit  34.31 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109385  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  27.45 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  29.35 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3062  DNA polymerase, beta-like region  32.99 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  28.95 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0988  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0677901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  36.96 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  41.33 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  37.33 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  45 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  39.24 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  45.45 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  37.5 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  32.1 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  27.16 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3124  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000343022  unclonable  0.0000116735 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1320  DNA polymerase beta subunit  46.81 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.475196  normal  0.327189 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5174  HEPN domain-containing protein  26.8 
 
 		 310 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0411727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  34.33 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  29.73 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  29.63 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0821  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.29047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  33.82 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  28.79 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  25.64 
 
 		 304 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  32.05 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  32.05 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  36.54 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2319  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000830496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  27.78 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  33.01 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  29.63 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  28.42 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  32.88 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  29.2 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  31.65 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  34.67 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  29.49 
 
 		 209 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  29.11 
 
 		 107 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2779  DNA polymerase beta subunit  47.06 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  28.09 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  32.47 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  40.82 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  32.08 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  24.72 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  46.67 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  33.72 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0132  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4231  nucleotidyltransferase  31.71 
 
 		 302 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00450243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  24.14 
 
 		 141 aa  40  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  54.05 
 
 		 98 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>