52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4127 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  49.07 
 
 		 117 aa  97.1  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  39.66 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  49.38 
 
 		 121 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  44.05 
 
 		 115 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  38.3 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  40.74 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  34.86 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  38.82 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  31.07 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.91 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  42.53 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.91 
 
 		 128 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  34.91 
 
 		 128 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  34.91 
 
 		 128 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 111 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  32.71 
 
 		 116 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 111 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 		 116 aa  52  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  27.45 
 
 		 104 aa  51.2  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  34.95 
 
 		 116 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 108 aa  51.2  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 120 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  25 
 
 		 116 aa  48.9  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  31.82 
 
 		 110 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  36.9 
 
 		 109 aa  48.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  30.12 
 
 		 106 aa  48.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  33.62 
 
 		 126 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  26.21 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  30.1 
 
 		 111 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  39.71 
 
 		 135 aa  45.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  33.68 
 
 		 117 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 118 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  40 
 
 		 102 aa  45.1  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  37.04 
 
 		 103 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  31.07 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.89 
 
 		 103 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  37.8 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 122 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 113 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  31.71 
 
 		 107 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  32.04 
 
 		 111 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  31.65 
 
 		 121 aa  42.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 116 aa  42  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  29.7 
 
 		 99 aa  42  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  36.23 
 
 		 116 aa  41.6  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  32 
 
 		 119 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 109 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  36.45 
 
 		 112 aa  41.2  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.1 
 
 		 166 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>