66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2432 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 111 aa  230  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  61.26 
 
 		 111 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  46.23 
 
 		 116 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  47.22 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  45.28 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  40.78 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  37.38 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  39.25 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  38.54 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  39.36 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.33 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  36.36 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  36.36 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  36.36 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  37.86 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  33.02 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  36.27 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  40.82 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  36.61 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  37.61 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  37.93 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  36.73 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  34.31 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  38.27 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  30.56 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  33.02 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  30.1 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  38.2 
 
 		 191 aa  52  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  39.29 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  29 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  29.25 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  36.14 
 
 		 166 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  31.13 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  41.51 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  39.71 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  35.56 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  29 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  32.38 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  27.88 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  29.76 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 		 92 aa  42.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  32.73 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  32.04 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  32.5 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  31.63 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3023  hypothetical protein  51.22 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0907322  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  31.82 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  26.47 
 
 		 103 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  38.1 
 
 		 99 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  32.11 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  46.81 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  39.13 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  35.19 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0811  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 257 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2987  nucleotidyltransferase domain protein  46.67 
 
 		 234 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>