35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0104 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 114 aa  218  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  32.73 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  40.96 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1200  DNA polymerase beta subunit  34.55 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  36.14 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  31 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  29.55 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  29.9 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  24.07 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  29.25 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  28.28 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1008  DNA polymerase beta subunit  34.69 
 
 		 281 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  37.29 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  47.62 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  33.65 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  29.25 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  31.78 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  28.7 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  31.75 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  33.82 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  30.93 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  50 
 
 		 247 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  37.25 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  34.94 
 
 		 111 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  32.65 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  32.91 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  32.29 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0086  DNA polymerase beta subunit  39.39 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109385  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.95 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  37.88 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  51.43 
 
 		 128 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>