31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2641 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  55 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  34.52 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1320  DNA polymerase beta subunit  35.19 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.475196  normal  0.327189 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  27.38 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0821  DNA polymerase beta subunit  35.11 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.29047 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  31.48 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  31.43 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  48.78 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0587  DNA polymerase beta subunit  33.67 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.838533 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0385  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  30.11 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  29.07 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1089  DNA polymerase beta subunit  31.63 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.947057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  51.35 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  29 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  32.97 
 
 		 116 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  25.56 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0988  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0677901 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  37.25 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  44.12 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  32.91 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  32.39 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  59.38 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  53.57 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  69.57 
 
 		 111 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>