68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0574 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 120 aa  240  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  68.85 
 
 		 121 aa  166  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  65.29 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  43.96 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  46.74 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  44.86 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  38.54 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  43.14 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  38.71 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  42.99 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  37.62 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  42.7 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  38.83 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  35.45 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  41.75 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  43.75 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.07 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  33.07 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  33.07 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  40.85 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  36.08 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  41.41 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  38.75 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  38.78 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  38.3 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  34.34 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  34.65 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.34 
 
 		 166 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  41.43 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  34.34 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  38.1 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  36.96 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  35.71 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  38.3 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  41.46 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  35.63 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  31.68 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  37.23 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0132  DNA polymerase beta subunit  33.68 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  35.63 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.41 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  42.86 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  32.04 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  58.33 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  45.1 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0603  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  31.37 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  32.58 
 
 		 113 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  32.69 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  35.56 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2515  hypothetical protein  31.07 
 
 		 308 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  51.16 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  32.46 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  53.33 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  26.61 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2595  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  56.25 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  31.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  31.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>