29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3011 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 107 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  73.68 
 
 		 110 aa  151  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  41.3 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4026  DNA polymerase beta domain protein region  46.05 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13820  Nucleotidyltransferase domain protein  38.46 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  32.99 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  32.71 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  32.73 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  39.77 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  32.58 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3091  DNA polymerase, beta-like region  39.62 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0669  DNA polymerase, beta-like region  43.1 
 
 		 95 aa  47.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558725  normal  0.557112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  29.89 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  51.06 
 
 		 53 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  34.67 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  34.21 
 
 		 199 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  34.15 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  29.11 
 
 		 121 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  35.06 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  34.85 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  36.49 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  25.93 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 115 aa  40  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>