29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0489 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 111 aa  226  9e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  45.28 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  34.26 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  38.83 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1459  DNA polymerase beta subunit  38.94 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0464  DNA polymerase beta subunit  38.38 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0242812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  42 
 
 		 107 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  59.38 
 
 		 122 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  43.59 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  39.66 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  48 
 
 		 174 aa  41.2  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  38.46 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  61.54 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  80 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  38.64 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  36.49 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  59.38 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  48.84 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  57.89 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  39.13 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 100 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>