11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0464 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0464  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0242812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  64 
 
 		 104 aa  136  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  39.33 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  38.38 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1433  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.855989  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  48.78 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1268  DNA polymerase beta subunit  34.44 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.834804 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  45.28 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  30.95 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>