10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1433 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1433  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 133 aa  264  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.855989  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1268  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.834804 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1435  DNA polymerase beta subunit  29.35 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000437505  decreased coverage  0.0000020199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0464  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0242812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  26.67 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  29.46 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>