13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1435 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1435  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 109 aa  213  5e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000437505  decreased coverage  0.0000020199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1268  DNA polymerase beta subunit  46.79 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.834804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2681  DNA polymerase beta domain protein region  42.45 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  41.41 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  43.81 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0999  DNA polymerase beta subunit  37.76 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0343888  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1689  DNA polymerase beta subunit  38.54 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000949041  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1433  DNA polymerase beta subunit  29.35 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.855989  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 141 aa  48.1  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  34.91 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  25.71 
 
 		 104 aa  43.9  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>