33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0506 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 121 aa  248  3e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  56.36 
 
 		 110 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1476  DNA polymerase beta subunit  82.76 
 
 		 80 aa  100  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  34.95 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  37.89 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1459  DNA polymerase beta subunit  41.59 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  39.74 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1154  DNA polymerase beta subunit  44.83 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.855122  normal  0.0599495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  39.71 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  54.55 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  48.78 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1435  DNA polymerase beta subunit  34.91 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000437505  decreased coverage  0.0000020199 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1433  DNA polymerase beta subunit  26.67 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.855989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0999  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0343888  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  27.78 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  34.41 
 
 		 99 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  34.18 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  43.14 
 
 		 109 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  46.81 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0464  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0242812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0998  DNA polymerase beta subunit  48.98 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0594708  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  58.82 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1689  DNA polymerase beta subunit  31 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000949041  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  41.18 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  46.67 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  41.51 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1757  DNA polymerase, beta-like region  40.28 
 
 		 104 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.1342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>