8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1154 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1154  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 147 aa  287  4e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.855122  normal  0.0599495 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1459  DNA polymerase beta subunit  65.67 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  50.88 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  34.25 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  44.83 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>