34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0718 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 112 aa  226  9e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  36.45 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  34.26 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  42.42 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  48.15 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  39.74 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  38.71 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1154  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.855122  normal  0.0599495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  39.77 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  37.89 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1459  DNA polymerase beta subunit  44.23 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  41.1 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  53.66 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  41.89 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  38.46 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0999  DNA polymerase beta subunit  31.73 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0343888  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  42.42 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1689  DNA polymerase beta subunit  37.11 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000949041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  36.9 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  43.4 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.37 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  46.77 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 132 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  75 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  41.79 
 
 		 116 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.1 
 
 		 103 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  33.68 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  46.67 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  31.76 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  36.11 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  30.85 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  51.22 
 
 		 106 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>