64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1617 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  100 
 
 		 103 aa  205  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  60.95 
 
 		 105 aa  123  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  41.18 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  40.62 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  38.54 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  38.54 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  41.3 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  32.67 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  34.65 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  45.16 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  41.43 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  33.66 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  38.37 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  32.98 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1089  DNA polymerase beta subunit  35.92 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.947057 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  33 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  30.93 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  34 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  34 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  34 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  37.14 
 
 		 102 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  34 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  35.92 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  27.45 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  29.29 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  31.43 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.845588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  46.81 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  31.4 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  35.29 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  41.41 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  33.01 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  38 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  37.23 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  30.59 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0837  DNA polymerase beta domain protein region  38.1 
 
 		 286 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  40.7 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2162  DNA polymerase beta subunit  46.15 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  51.28 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  38.1 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  36.89 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  37.11 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  37 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  64.29 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  51.02 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 112 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  29.23 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0234  DNA polymerase beta domain protein region  39.13 
 
 		 265 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.126142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  32.32 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  30.1 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  80 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  28.05 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  40 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  42.59 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  48.89 
 
 		 230 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  35.42 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  33.75 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>