43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0365 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  34.74 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  33.02 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  32.29 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  39.71 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  29 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  30.53 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  30.39 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  28.12 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  36.76 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  35.42 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  47.27 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  39.74 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  34.34 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  32.58 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  33.98 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  30.69 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  30.59 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0871  hypothetical protein  30 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.845588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 137 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  53.85 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  41.82 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  45.45 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  39.13 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  39.13 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  52.38 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  37.18 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  28.74 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>