28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3303 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 114 aa  224  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  33.03 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  48.89 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  46.81 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  27.45 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  53.33 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  45.45 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  75 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  44 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  23.71 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  30.34 
 
 		 146 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  46.77 
 
 		 127 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1757  DNA polymerase, beta-like region  48.08 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0821  DNA polymerase beta subunit  73.08 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.29047 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1347  DNA polymerase beta subunit  55.1 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.103374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  53.12 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  32.39 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  34.44 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  28.28 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2129  DNA polymerase beta domain protein region  28.05 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0318701  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0404  nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.15 
 
 		 148 aa  40  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.108066  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  31.76 
 
 		 132 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>