31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3436 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 107 aa  217  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  41.54 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  41.25 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  54.35 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  29.29 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  36.25 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  37.5 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0821  DNA polymerase beta subunit  40.3 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.29047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  54.29 
 
 		 230 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  34.57 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  60.71 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  44.44 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  38.75 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  62.07 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  38.37 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  34.57 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  42 
 
 		 111 aa  42  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  64 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  50 
 
 		 254 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  48.94 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  36.59 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  31.88 
 
 		 131 aa  40.8  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1089  DNA polymerase beta subunit  58.82 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.947057 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  32.43 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>