51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3962 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 105 aa  203  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  31.37 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  36.46 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.37 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  41.38 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  37.97 
 
 		 116 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  38.55 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  32.65 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  41.25 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  28.41 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  26 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  26 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  26 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  26 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  26.92 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  28.43 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  30.49 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  31.37 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  32.86 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  38.81 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  46.77 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  31.31 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  39.06 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  31.33 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  40.96 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  36.49 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  35.19 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  43.06 
 
 		 100 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  42.22 
 
 		 132 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  31.73 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  32.98 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  34.85 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  34.44 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2162  DNA polymerase beta subunit  34.25 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  23.76 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  42.62 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  53.33 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  45 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  34.94 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>