35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4484 on replicon NC_011721
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 146 aa  300  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  36.19 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  29.09 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0217  hypothetical protein  29.66 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  35.79 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  33.09 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  34.44 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  27.52 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  25.18 
 
 		 295 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  30.85 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  28.15 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3173  DNA polymerase beta subunit  31.07 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  31 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  30.51 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  32.17 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  27.27 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  31.01 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  25.2 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  27.66 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  25.76 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  64 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  27.97 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  35.37 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  32.04 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  29.7 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  30.34 
 
 		 114 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  32.98 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  27.66 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3751  hypothetical protein  29.09 
 
 		 260 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00100  nucleotidyltransferase family protein  36.36 
 
 		 255 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  0.283746 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  22.95 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  28.3 
 
 		 241 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  33.9 
 
 		 257 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  26.45 
 
 		 151 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>