63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2281 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  100 
 
 		 132 aa  270  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  52.27 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  52.27 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  53.73 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  52.8 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  49.57 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  39.55 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  39.47 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  36.94 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  39.09 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  34.23 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  36.92 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  35.34 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  37.38 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  36.29 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  32.73 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  31.71 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  34.29 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  34.83 
 
 		 241 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  32.95 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  36.47 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  31.86 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  30.51 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  36.99 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  32.38 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  31.07 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  30.1 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  32.98 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  31.46 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  35.62 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  44.59 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  28 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  28.26 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  29 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  27.78 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  32.26 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  30.51 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0217  hypothetical protein  32.18 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  31.01 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  37.31 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  30.69 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  28.81 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  30.67 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 99 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.92 
 
 		 96 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  32.73 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  30.56 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  30.95 
 
 		 116 aa  40.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  51.52 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  26.85 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  30.1 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  51.35 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  27.66 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  30.14 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>