38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3253 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  38.1 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  39.68 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  33.64 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  34.48 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  32.38 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  32.99 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  34.75 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  35.9 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  36.78 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1223  DNA polymerase beta domain protein region  29.46 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  31.86 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  38.98 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  30.1 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  32.81 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  34.48 
 
 		 241 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  36.49 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  25.71 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  32.48 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  30.71 
 
 		 167 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  25.56 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  27.78 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  26.45 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  27.97 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  28 
 
 		 140 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  22.95 
 
 		 146 aa  40.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  46.15 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  32.14 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1950  DNA polymerase beta domain protein region  45.95 
 
 		 158 aa  40.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  36.14 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  32.39 
 
 		 100 aa  40  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  31.08 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>