64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2422 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 135 aa  276  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  54.33 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  50.78 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  52.8 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  50.78 
 
 		 135 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  52.17 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.6 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  40.78 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  32 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  41.07 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  34.23 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  26.15 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  33.9 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  33.63 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  35.85 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  33.03 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  32.23 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  31.07 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  39.47 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  31.4 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  31.09 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  28.44 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  33.09 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  27.72 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  35.53 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  33.73 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  29.09 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 241 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  33.66 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  30.33 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  36.11 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0217  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  30.68 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  31.91 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  36.47 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  36.47 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  30.14 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  25.69 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  28.7 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  36.19 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  30.11 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  32.69 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  30.14 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  28.87 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  29.79 
 
 		 276 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  27.64 
 
 		 129 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  29.79 
 
 		 295 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  28.97 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  26.83 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  35.06 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  30.09 
 
 		 292 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  24.47 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  33.7 
 
 		 157 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>