33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0209 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  283  7e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  42.42 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  34.15 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  32.31 
 
 		 271 aa  64.3  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  29.32 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  33.04 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  37.38 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  27.05 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  33.08 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  30.08 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  26.05 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0172  nucleotidyltransferase  29.29 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  25 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  31.73 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  26.61 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  30.19 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1182  hypothetical protein  26.36 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  31.93 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0320  DNA polymerase beta subunit  27.72 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  31.45 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  27.5 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  22.88 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  27.88 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  29.09 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  29.13 
 
 		 241 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  26.67 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  35.64 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  28.85 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  26.36 
 
 		 295 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  33 
 
 		 147 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  24.47 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>