26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0172 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0172  nucleotidyltransferase  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  42.59 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  35.64 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  33.02 
 
 		 271 aa  60.1  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0320  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  33.04 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  34.65 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  35.42 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  31.68 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  31.25 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  29.59 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  29.82 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  33.67 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 155 aa  42  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  30.93 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  40.26 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 146 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  35.62 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  32.56 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1182  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422809  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0129  DNA polymerase beta domain protein region  30.63 
 
 		 147 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00283824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>