17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1692 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 139 aa  266  5e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  50.85 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1182  hypothetical protein  38.26 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422809  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  29.85 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0320  DNA polymerase beta subunit  33.87 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  30.1 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  37.11 
 
 		 271 aa  52.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  48.68 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  34.07 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1025  DNA polymerase beta subunit  36.96 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.278001  normal  0.373877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  32.56 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  29 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  35.64 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  24.24 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  37.66 
 
 		 250 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>