117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0250 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  42.02 
 
 		 271 aa  93.2  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  39.32 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  42.31 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  42.34 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  35.88 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  31.06 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  41.9 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  32.31 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  28.81 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  33.91 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  34.4 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  36.52 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  35.45 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  33.9 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  38.6 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  31.53 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  36.73 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  40.82 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  36.19 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  35.37 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  44.59 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  31.78 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  37.39 
 
 		 250 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  33.9 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  38.61 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  47.14 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  41.18 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  40.54 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  30.69 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  30.19 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  29.09 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  34.88 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  30.4 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  39.53 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  35.79 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  34.62 
 
 		 292 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 169 aa  47  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3028  hypothetical protein  44.44 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0421336  normal  0.501717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  36.78 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  39.73 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  29.47 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  34.52 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0320  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3941  DNA polymerase beta domain protein region  32.71 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  37.08 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  39.73 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  40.32 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  37.21 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  40.58 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  40.28 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  37.18 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  34.18 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  40.26 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.23 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2550  DNA polymerase beta domain protein region  37.38 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0464694 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0131  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  36.84 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  33.77 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  40.91 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  34.72 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  25.95 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  32.63 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 132 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  30.1 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  31.87 
 
 		 145 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  36.59 
 
 		 104 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 113 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  39.02 
 
 		 96 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  43.04 
 
 		 96 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  33.94 
 
 		 144 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 132 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  46.15 
 
 		 129 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  35.16 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  43.59 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  37.14 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1065  DNA polymerase beta domain protein region  57.14 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.513193  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  43.94 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>