20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1438 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 129 aa  259  6.999999999999999e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  50.85 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0320  DNA polymerase beta subunit  39.5 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  30.83 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1025  DNA polymerase beta subunit  37.37 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.278001  normal  0.373877 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  30.08 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  37.27 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  33.9 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  31.68 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1182  hypothetical protein  31.9 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422809  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  36.78 
 
 		 250 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  32.11 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  31.11 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 139 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3517  DNA polymerase beta subunit  31 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.909261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  30.19 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  30.69 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  31.91 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  26.92 
 
 		 102 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>