132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2757 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  100 
 
 		 102 aa  200  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  44.55 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  43.56 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  43.3 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  46.32 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  48.42 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  41.05 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  45.36 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  49.41 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  44.21 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  44.21 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  32.97 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  37.11 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  39.24 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  33.68 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  38.64 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  45.33 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  39.18 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  39 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  37.93 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  33 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  33.72 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  35.79 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  41.3 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  40.86 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  40.86 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  35.64 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  38.37 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  40.45 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  35.23 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  30.43 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  39.24 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  37.04 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  34.88 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  33.68 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  37 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  31.91 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  31.91 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  34.15 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  36.9 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  30.93 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  39.74 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1518  DNA polymerase beta domain protein region  44.74 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  34.29 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  40.62 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  33.7 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  39.24 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  35.14 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  32.53 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  35.53 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  35.06 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  38.75 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  34.15 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1728  hypothetical protein  43.33 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  27.96 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  26.32 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  35.53 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.33 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  30.85 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  28.43 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  28.75 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  27.85 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  30.23 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  26.14 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  32.56 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  27.08 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  35.37 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  29.49 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  36.67 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  32.86 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  32.98 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  30.85 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  24.05 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  29.49 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  31.03 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 254 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  28.75 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  26.09 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  28.21 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  27.59 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>