146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1162 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 100 aa  196  7.999999999999999e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  52.08 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  53.19 
 
 		 103 aa  110  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0208  hypothetical protein  83.61 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0639288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  51 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 96 aa  97.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  51.25 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  52.75 
 
 		 94 aa  93.6  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  48.75 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  48 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  42.71 
 
 		 100 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  45.78 
 
 		 87 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  43.43 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  43.43 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  45.36 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  41.49 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  46.84 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  32.97 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  40.82 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  45.12 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  42.11 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  41.24 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  40.62 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  37.76 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  44.58 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  41.86 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  45.33 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  45.33 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  43.42 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  36.56 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  43.62 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  40.74 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  39.08 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  35.87 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  42.5 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  39.13 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  39.33 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  38.55 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  38.16 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  40.4 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  38.46 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  45.71 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  34.04 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  41.98 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  44.05 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1518  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  35.05 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  41.18 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  34.44 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  38.36 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  39.13 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  39.44 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  43.06 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  43.9 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  31.87 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  40.85 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  38.27 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  28.85 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  41.46 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  28.85 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0146  nucleotidyltransferase family protein  33.33 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0363177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.25 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  40.23 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  32.93 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  33.75 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  34.33 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  32.5 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1728  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  36.78 
 
 		 113 aa  48.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  39.39 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 98 aa  47.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  26.53 
 
 		 97 aa  47.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3539  DNA polymerase, beta-like region  34.09 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418484  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  36.99 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  29.79 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1484  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  34.92 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  40.85 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  36.56 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  31.65 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  27.55 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  34.78 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  35.23 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>