18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0208 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0208  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  243  9e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0639288  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  83.61 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  55.56 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  51.56 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  54.1 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  47.62 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  42.62 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  45.31 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  39.34 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  39.34 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  42.19 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  42.19 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  51.16 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  47.92 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  47.17 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  46.3 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  42.19 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  32.26 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>