106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1036 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 96 aa  188  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  45.74 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  46.81 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  44.44 
 
 		 100 aa  97.4  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  47.83 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  46.32 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  46.74 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  41.3 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  43.9 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  48.1 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  43.3 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  42.35 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  42.35 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  35.11 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  42.35 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  36.46 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  35.05 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  36.56 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  34.02 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  34.94 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  36.14 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  31.87 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  30.93 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  34.44 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  32.22 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  39.51 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  32.63 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  24.74 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  32.95 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  35.56 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  30.53 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0208  hypothetical protein  39.34 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0639288  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.22 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.75 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  37.11 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  36.67 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  27.66 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  30.77 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  30.38 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  36.84 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  26.88 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1518  DNA polymerase beta domain protein region  41.56 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  35.14 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  30.43 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  35.35 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  32.89 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  28.12 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  31.46 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  35.48 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  30.67 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  26.14 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  32.43 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  35.62 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  30.14 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  29.27 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  34.25 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  32.56 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  34.25 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  32.56 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  28.74 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  30.38 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  23.6 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  32.26 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  27.03 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  27.14 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  33.77 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  29.49 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  25.97 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  27.63 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  31.88 
 
 		 98 aa  42  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0146  nucleotidyltransferase family protein  45.65 
 
 		 106 aa  42  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0363177  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  26.25 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  27.91 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  27.91 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  27.06 
 
 		 169 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  23.08 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  30.56 
 
 		 254 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  29.89 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>