149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2493 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  100 
 
 
96 aa  192  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  52.13 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  48.94 
 
 
96 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  45.83 
 
 
96 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  42.71 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  48 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  41.49 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  46.32 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  41.49 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  39.58 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  39.05 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  39.05 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  41.18 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  38.04 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  36.56 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1292  DNA polymerase beta domain protein region  47.87 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  33.7 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  42.05 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  47.44 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  35.87 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  38.55 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  38.55 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  39.36 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  37.63 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  34.41 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  35.96 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  46.77 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  34.07 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  41.33 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  36.56 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 
106 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  39.02 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  38.27 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  40.74 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  34.09 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  34.88 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  39.29 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  37.04 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  37.18 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  35.63 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  36.59 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  44.62 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  31.91 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  39.02 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  31.25 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  34.48 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  36.76 
 
 
104 aa  52  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  36.05 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  36.05 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.33 
 
 
101 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  32.58 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  38.75 
 
 
254 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  35.42 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  43.75 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  32.14 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  37.21 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  34.33 
 
 
102 aa  50.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 
169 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  37.14 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  38.03 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  37.5 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  38.96 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  34.67 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  45.16 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  38.55 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  39.53 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  28.87 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  36 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  38.82 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  38.75 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  31.76 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  31.11 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 
100 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
101 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  37.31 
 
 
105 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  40.48 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  35.63 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  31.76 
 
 
102 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  33.8 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>