159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1228 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 97 aa  191  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  61.96 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  54.84 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  52.69 
 
 		 97 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  58.89 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  57.14 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  49.46 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  48.91 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  50.54 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  51.09 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  51.06 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  51.06 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  49.48 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  47.31 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  43.33 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  66.15 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  44.09 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  45.16 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  43.48 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  46.24 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  44.09 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  44.9 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  43.37 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  42.05 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  43.33 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  41.76 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  42.53 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  42.7 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  43.16 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  39.78 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  43.84 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  43.84 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  39.33 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  37.21 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  34.78 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  41.3 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  46.77 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  42.17 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  42.5 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  40.22 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  36.56 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  37.18 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  42.22 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  44.05 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  43.37 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  32.99 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  42.55 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  43.42 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  36.46 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  41.38 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  38.14 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  40.23 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4395  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0622266 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  45.59 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  40.23 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  34.44 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  43.06 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  37.68 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  38.96 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  36.05 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  41.94 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  41.25 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  39.08 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  46.38 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  37.08 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  35.37 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  30.53 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  34.21 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  33.68 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  36.84 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.05 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  36.96 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  43.48 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  40.4 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  36.26 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  38.04 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  37.18 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  37.63 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>