70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1652 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  100 
 
 		 69 aa  137  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  78.26 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  59.42 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  59.42 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  57.97 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  57.97 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  56.52 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  57.97 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  55.07 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  52.17 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  59.42 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  37.68 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  59.42 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  37.68 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  40.58 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  40.91 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  35.38 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  40.85 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  41.54 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  35.38 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  37.68 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  44.78 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  36.23 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  36.23 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  43.28 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0012  DNA polymerase, beta-like region  55.38 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0162009  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  41.43 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  37.31 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  41.43 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.35 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  37.68 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  42.65 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  37.68 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  31.88 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  42.03 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  37.04 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  35.21 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  35.82 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  28.99 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  37.14 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  37.14 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  35.21 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  34.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  39.71 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  35.48 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  33.85 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  31.88 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  41.82 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  44.12 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  28.36 
 
 		 96 aa  40.8  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  39.13 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  30.43 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  33.82 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  33.82 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2046  hypothetical protein  56.25 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  35.82 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.31 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  40.82 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 101 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 96 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>