115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3260 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 152 aa  292  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  43.62 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  37.72 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  49.35 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  44.3 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  43.24 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  37.93 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  45.45 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  45.45 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  37.89 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  39.58 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  28.33 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  33.04 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  42.37 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  42.65 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  32.73 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  35.56 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  34.67 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  25.93 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  25.93 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  41.57 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  43.08 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  35 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  36.47 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  36.36 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  40.62 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  50 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  31.52 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  52.83 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  34.67 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  50 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  29.29 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 108 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 108 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  29.29 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  42.65 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  37.93 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  31.08 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  36.76 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  42.65 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  30.12 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  41.43 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5258  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  34.43 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.9 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  42.42 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  32.86 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  45.1 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  44 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  44 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  35.29 
 
 		 102 aa  43.9  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0162  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 77 aa  43.9  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  30.95 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2046  hypothetical protein  42.37 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  36.76 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  31.03 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  35.06 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.26 
 
 		 96 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.26 
 
 		 96 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 134 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  42.65 
 
 		 100 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 277 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1891  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 117 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00988673  normal  0.0163804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  35.16 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  38.46 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  33.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0557  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  29.73 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  47.37 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1345  DNA polymerase, beta-like region  43.48 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 272 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 		 97 aa  41.2  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>