103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1104 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 96 aa  193  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  66.67 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  56.99 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  54.35 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  52.08 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 96 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  44.79 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  46.88 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  47.92 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  59.42 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  49.35 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  48.96 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  48.96 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  45.98 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  44.71 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  42.53 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  40.48 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0012  DNA polymerase, beta-like region  51.22 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0162009  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  43.37 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  40.7 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  45.98 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  40.23 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  39.36 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  39.8 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  39.36 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  35.11 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  41.05 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  43.02 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  44.58 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  44.19 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2046  hypothetical protein  48.33 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  34.52 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  35.37 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  40.54 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  39.36 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1345  DNA polymerase, beta-like region  52.17 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  32.53 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  32.53 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  38.2 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  31 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  31 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  32.86 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  36.26 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  33.7 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  30.59 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  30.59 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  37.04 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  39.29 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  36.62 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  33.8 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  26.74 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  33.68 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  27.96 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  37.21 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  34.21 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  31.18 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  34.67 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  34.72 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  38.16 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  28.16 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  31.94 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  27.47 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  32.99 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  40.28 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  35.62 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  34.18 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  28.12 
 
 		 113 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  29.85 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  28.12 
 
 		 113 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  30.56 
 
 		 108 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  26.39 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  28.09 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  29.85 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  28.17 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  28.17 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  29.07 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  27.71 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  35.94 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  35 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  34.88 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  31.43 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  30.14 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  28.4 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  29.07 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>