24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4395 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4395  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  237  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0622266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  49.43 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  54.17 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  44.23 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  40.21 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  43.33 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  51.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  57.14 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  48.98 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  46.94 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  37.31 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  43.1 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  43.1 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  48.98 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  47.92 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  48.89 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  44.9 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  43.75 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  51.16 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  41.51 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  35.56 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  37.25 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>