165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3299 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 96 aa  187  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  81.25 
 
 		 96 aa  161  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  75.56 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  61.05 
 
 		 98 aa  120  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  57.73 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  56.7 
 
 		 98 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  54.84 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  60.44 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  51.55 
 
 		 97 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  51.55 
 
 		 97 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 96 aa  99.4  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  47.06 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  50.55 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  48.89 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  44.33 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  48.96 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  54.17 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  38.95 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  46.74 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  46.67 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  44.68 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  45.26 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  39.58 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  38.95 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  44.71 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  42.7 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  42.22 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  41.76 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  62.3 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  42.22 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  43.75 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  41.56 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  45.56 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  43.42 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  39.78 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  43.42 
 
 		 96 aa  67  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  41.24 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  43.3 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  38.14 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  41.05 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  42.05 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  35.29 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  39.56 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  44 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4395  hypothetical protein  54.17 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0622266 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  41.46 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  38.54 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  41.56 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  40.21 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  36 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  42.27 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  40.54 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  34.88 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  31.91 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  37.78 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  37.68 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  34.41 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  32.26 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  34.04 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  36.05 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  29.79 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.82 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  34.44 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  40.74 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  45.07 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  34.07 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  38.67 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  41.98 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  35.62 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  35.62 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  41.1 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.62 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.62 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  39.44 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  30.11 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  36.71 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  33.7 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  35.06 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>