123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0898 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 103 aa  208  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  62.24 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  48.96 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  52.63 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  47.47 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  43.14 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  41.05 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  40.86 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  43.48 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  43.01 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  39.39 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  39.18 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  38.38 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  38.24 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  36.08 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  37.76 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  38.71 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  36.27 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  36.27 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  41.38 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  41.76 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  37.36 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  41.76 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  37.36 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  43.66 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  43.42 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  45.45 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  37.07 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  39.08 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  35.35 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  43.75 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  45.12 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  36.96 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  41.77 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  38.04 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  39.29 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  47.62 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  47.62 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  40.7 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  39.77 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  33.7 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  39.13 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  37.36 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  36.96 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  37.23 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  36.9 
 
 		 95 aa  48.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  41.18 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  37.33 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  42.19 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  33.71 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  41.79 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  34.48 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  46.77 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  44.9 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  40 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  32.88 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  35.06 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  32.99 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  45.16 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  34.85 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  34.12 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  56.41 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  33.7 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  38.33 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  40.62 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  32.58 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  32.26 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  37.36 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  35.96 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  34.09 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  35.63 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  33.78 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  40 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  32.94 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  36.36 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  35.38 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2185  hypothetical protein  36.11 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.141631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  38.82 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  40.3 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>