91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0587 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 76 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  41.79 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  41.27 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  44.83 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  41.82 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  43.1 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1114  nucleotidyltransferases-like  47.46 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  41.27 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  39.06 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  45.83 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  45.83 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  43.4 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  51.22 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  48.28 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  47.83 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  44.9 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  45.45 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  46 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  35.48 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  35.71 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  35.59 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  52.17 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  47.5 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  47.5 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  48.84 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  48.98 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  42.59 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  35.85 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  39.13 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  38.78 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  34.55 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  41.82 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  56.41 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  44.83 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  34.48 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  45.28 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  30.88 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  55.56 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  57.14 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  57.14 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  44.19 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  47.83 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  37.5 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  51.43 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  38.98 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  51.43 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  46.34 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  41.38 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  50 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  36.96 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  45.65 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  25.68 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  36.51 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  27.12 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  57.14 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  40.35 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  51.43 
 
 		 86 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  53.85 
 
 		 96 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  43.18 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  48.21 
 
 		 109 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1757  DNA polymerase, beta-like region  43.18 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  41.18 
 
 		 99 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  46.15 
 
 		 98 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  45 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  45 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  54.29 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  35.19 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  55.88 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  40 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1518  DNA polymerase beta domain protein region  43.75 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  31.43 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  43.18 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  45.24 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  43.9 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  36.54 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  37.5 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  36.36 
 
 		 95 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>