43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1114 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1114  nucleotidyltransferases-like  100 
 
 
105 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  47.46 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  52 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  46.94 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  46.94 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  44.9 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  42.19 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  47.17 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  44.68 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  44.68 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  39.58 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  43.94 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  42 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  44.9 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  45.83 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  52.78 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  49.06 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  40.82 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  36.23 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  42 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  45.65 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  45.65 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  46.55 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  42.55 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  43.1 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  43.75 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  46.15 
 
 
328 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  42 
 
 
86 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  38.33 
 
 
96 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  52.63 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  39.34 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  35.14 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  44 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  41.38 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  37.1 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  34.43 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  33.33 
 
 
97 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.324196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>